Ο Νίκος Ζήσης ήταν συνώνυμο των τίτλων για τις ομάδες που υπηρέτησε στην καριέρα του.
Συμμετείχε στην κατάκτηση των τριών τελευταίων μεταλλίων της Εθνικής ομάδας, του χρυσού στο Ευρωμπάσκετ του 2005, του ασημένιου στο Παγκόσμιο του 2006 και του χάλκινου στο Ευρωπαϊκό του 2009. Με το εθνόσημο κατέκτησε επίσης το χρυσό U20 το 2002 το ασημένιο U16 το 1999 και το χάλκινο U18 το 2000. Συνολικά φόρεσε τη φανέλα της Εθνικής Ανδρών 189 φορές.
Σε συλλογικό επίπεδο κατέκτησε με την ΑΕΚ ένα πρωτάθλημα (2002) και δύο Κύπελλα (2001, 2020), με την Μπενετόν Τρεβίζο το πρωτάθλημα (2006), το Κύπελλο (2007) και το Σούπερ Καπ (2007), με την ΤΣΣΚΑ Μόσχας την Ευρωλίγκα (2008), δύο πρωταθλήματα (2008, 2009), και την VTB League (2009), με τη Σιένα τρία πρωταθλήματα (2010, 2011, 2012), τρία Κύπελλα (2010, 2011, 2012) και τρία Σούπερ Καπ (2010, 2011, 2012), με την Ούνιξ το Κύπελλο Ρωσίας (2014) και με την Μπάμπεργκ δύο πρωταθλήματα (2016, 2017), δύο Κύπελλα (2017, 2019) και το Σούπερ Καπ (2015).
Δικαίως, λοιπόν, συγκαταλέγεται στη λίστα όχι μόνο των κορυφαίων, αλλά και των πλέον πετυχημένων Ελλήνων παικτών στην ιστορία του μπάσκετ.